“年轻”的单细胞测序技术,在揪出癌症的背后“凶手”

2021-02-02
世界上没有两片相同的叶子,同样,也没有完全相同的细胞。

世界上没有两片相同的叶子,同样,也没有完全相同的细胞。

受精卵在发育过程中,基因表达的差异会导致细胞与细胞之间呈现差异化,最终分化成各种组织和器官,有些分化成神经元,有些成为骨骼肌,它们分别承担着不同的生理功能。肿瘤微环境中也存在着类似的异质性,并在近年来成为研究热点。由于单细胞测序能够检出传统bulk测序所无法得到的异质性信息,这将生命科学带入到一个新次元当中。

全球单细胞测序是从2009年开始起步,国内的单细胞测序技术也是在2014年才逐渐开始应用。诞生于2018年的百奥智汇是一家专注于单细胞测序应用的生物技术企业,致力于将单细胞组学和生物信息学最大化地应用于人类疾病诊断和治疗,通过创建人类疾病的精准细胞图谱,充分利用自身强大的科研能力、自有平台和数据,寻找全新的具突破性的治疗和诊断方法。

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本文文章插图来源于百奥智汇,经授权使用

传统的研究方法,大多是在多细胞水平中进行的,然而多细胞水平得到的是平均信号值,异质性信息被技术平台的缺陷掩盖,使得结果的准确性受到了影响。而单细胞测序则解决了分辨精度不足的问题,不仅能使科学家们以更高的精确度研究基本生物学和医学问题,还能同时分析成千上万个细胞。

例如在肿瘤组织中,肿块中心、肿块周围以及淋巴转移灶等细胞在基因组和转录组等遗传信息上均具有差异,通过单细胞测序技术的高分辨率,可以决定哪种细胞类型是对肿瘤最为有效的潜在靶点,为药物发现和研发提供强大的高质量数据基础。

在应用上,多样单细胞测序技术可以满足多层次研究的需要。目前,百奥智汇已开发出了单细胞RNA大数据可视化平台OmniBrowser,该平台拥有丰富的单细胞数据资源和多种搜索、可视化、分析工具,为药靶发现、药物研发、科研探索等赋能。

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本文文章插图来源于百奥智汇,经授权使用

据了解,目前该平台已收录涵盖超680项研究的数据集共计1490余个,超过18000个细胞群和2100万个细胞的基因组及其他研究数据。百奥智汇的数据团队会频繁定期地查询PubMed以更新数据库,找出与癌症、免疫学、神经科学和发育生物等有关的单细胞组学研究,并对其中影响力较大、用户需求的期刊给予更高的录入优先级。

另外,百奥智汇数据化平台的搭建是对行业数据利用率的极大提升。尽管大部分数据库中的数据来源都是公开发表的,但研究者们想要将自己感兴趣的领域的大量数据下载下来进行统计分析与数据比较,除了有能力去下载外,还需要整理,加注,格式化等多方面的数据处理,需要花费很多的时间和精力,还可能有所遗漏。百奥智汇通过标准化的萃取和整理,将数据系统化集成执行软件,能够让使用者更加高效便捷地获得准确的完整数据信息,从而大大节省时间成本,提高其科研和研发效率。另一方面,该平台还集成了多种可视化和分析工具,能够以图形界面展示和操作,大大降低了使用者的生物信息学门槛,让他们能够把更多的精力放在自己对科研问题的研究和发现。

此外,百奥智汇围绕单细胞组学建立起了单细胞基因组、单细胞转录组和单细胞染色质可及性测序方案和实验平台,从而满足生物学和医学研究者的研究需要。2019年10月,百奥智汇创始人兼科学顾问张泽民教授联合使用SMART-seq2和10x Genomics单细胞测序技术刻画肝癌免疫图谱,相关文章发表在国际顶级期刊《自然》上。

“百奥智汇在科学和技术方面的实力和底蕴,是公司发展的基础,特别是在数据方面,这得益于创始团队的多年雄厚积累。”CEO王泱洲博士说道。

百奥知汇的创始人张泽民博士现任北京大学教授,拥有16年的Genentech工作经验,曾任生物信息部主任和首席科学家,拥有60项专利,其中7项靶向药物进入了临床试验阶段,是国际知名的肿瘤基因组科学家。

而作为CEO,王泱洲博士也拥有着20多年的生物技术、制药和生命科学行业的管理和运营经验,曾任中美冠科生物技术股份有限公司首席运营官及董事。据悉,王泱洲博士加入百奥智汇后不久,公司就迅速扩展到目前的数十人,拥有了完整的业务团队,公司的科研结果也逐渐转变为标准化数据分析流程,为进一步的药物研发和转化应用打下了坚实的基础。

在商业化方面,除了通过数据化平台为药企等提供单细胞组学数据处理服务外,百奥智汇长期来还与药厂合作进行药物研发。王泱洲博士透露,百奥智汇在继续与国内外知名药厂合作的同时,还将自主研发候选药物和靶点增量,且已有药物靶点进入初步验证阶段。

王泱洲博士认为,从药物研发而言,中国市场对新药研发和靶点需求度更高,因此在国内新药市场上,百奥智汇面临较多机遇;而从商业角度来看,国外企业对临床性靶点的接纳程度大于国内传统生物医药企业,因此在国外市场来看,商业化程度将会更高。据了解,百奥智汇目前已在中美设立了双运营中心,将不断拓展国内外市场。

目前,百奥智汇已完成了A+轮融资,由软银中国资本领投,IDG资本、杏泽资本跟投。王泱洲博士介绍,本轮融资将主要用于系统性的扩大和加速单细胞大数据及单细胞数据分析在药物研发方面的应用,并进一步扩大商业化布局,加速建立系统和高效的国际化运营体系。

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